HTML5が騒がれている昨今ですがFlash Playerの需要はまだ0ではありません。
その一部として多いのがクリックしたりして使用するインタラクティブなFlash---すなわちゲームやアプリケーションです。
しかし問題ながら、LinuxのOperaではそのようなFlashコンテンツをクリックしても反応してくれません。
これは、/usr/lib/opera/pluginwrapper/operapluginwrapperの4行目に
export GDK_NATIVE_WINDOWS=1
を追加してOperaを再起動するだけで解決します。